Des chercheurs de l’Université de Berne ont décrit de nouveaux traitements anticancéreux contre le cancer du poumon non à petites cellules en analysant la «matière noire» du génome humain.
Le cancer est la deuxième cause de mortalité en Suisse. De tous les cancers, le cancer du poumon non à petites cellules tue le plus de patients et est incurable dans la plupart des cas. Les thérapies récemment approuvées peuvent prolonger la vie de quelques mois, mais très peu de patients survivront à long terme. Cela a encouragé les chercheurs de l’Université de Berne à explorer le génome humain à la recherche de nouveaux traitements contre le cancer.
Les chercheurs se sont tournés vers une classe de gènes mal comprise et sous-étudiée appelée « longs ARN non codants » (lncARN). Les LncRNA existent dans ce que l’on appelle la «matière noire» ou l’ADN non codant pour les protéines qui constitue la majeure partie du génome humain.
Le rôle des lncARN
Le génome humain contient environ 20 000 gènes réguliers codant pour des protéines et 100 000 ARNlnc. Actuellement, 99% des fonctions biologiques des lncRNAs sont inconnues. Les lncARN sont non codants, ce qui signifie qu’ils n’encodent pas les plans de construction des protéines, contrairement aux ARN messagers (ARNm).
Pour mieux comprendre le rôle du lncRNAs, les chercheurs ont examiné des ensembles de données pour savoir quels lncRNAs étaient présents dans cancer du poumon non à petites cellules. Les chercheurs ont identifié plus de 800 lncRNAs à étudier. Ils ont développé un système de criblage qui empêchait la production des lncRNA sélectionnés en supprimant une partie de leurs instructions de construction dans l’ADN.
Les chercheurs ont appliqué leur système de dépistage à deux lignées cellulaires de cancer du poumon non à petites cellules dérivées de patients. Ils ont examiné comment l’exclusion de certains lncRNA affectait les « caractéristiques » des cellules cancéreuses. Les caractéristiques sont des comportements cellulaires qui contribuent à la progression du cancer. Il s’agit de la prolifération, de la formation de métastases et de la résistance au traitement.
« L’avantage d’évaluer trois caractéristiques différentes du cancer est que nous avons une vue d’ensemble, mais aussi des quantités substantielles de données provenant de différentes expériences, à partir desquelles nous devions dériver une seule liste de longs ARN non codants qui sont importants pour le cancer du poumon non à petites cellules. », a déclaré Rory Johnson, professeur adjoint au Université de Bernequi a dirigé le projet.
Les chercheurs ont trouvé 80 ARNlnc candidats à haute confiance sur les 800 d’origine. Parmi les 80, plusieurs ont été sélectionnés pour une expérience de suivi. Les expériences de suivi ont montré que la destruction de la majorité des lncRNA inhibait la division des cellules cancéreuses. Le même traitement a eu peu d’effet sur les cellules pulmonaires non cancéreuses, qui ne devraient pas être lésées par les nouveaux traitements contre le cancer.
Le développement de nouveaux traitements contre le cancer va bientôt commencer
« Nous avons été positivement surpris de voir à quel point les oligonucléotides antisens pouvaient freiner la croissance tumorale dans différents modèles », a déclaré Taisia Polidori, co-première auteur de l’étude.
Les chercheurs sont prêts à poursuivre le développement de nouveaux traitements contre le cancer dans le cadre d’essais précliniques et espèrent collaborer avec des sociétés nouvelles et existantes pour développer de nouveaux médicaments. L’équipe de recherche pense également que leurs découvertes seront pertinentes pour d’autres cancers.
« Comme un télescope qui peut être assez facilement repositionné pour étudier une autre partie de l’espace, notre approche devrait être facilement adaptable pour révéler de nouveaux types de traitement potentiels pour d’autres types de cancer », a déclaré Roberta Esposito, co-première auteure et postdoc à l’Université de Berne. Le Dr Esposito utilisera désormais ses découvertes pour identifier de nouveaux traitements contre le cancer colorectal.
